Фамилия Матусев — типичный пример «внутреннего» русского суффикса -ев, который присоединяется к основе, оканчивающейся на мягкий согласный или шипящий. В данном случае основа — Матус, а вся фамилия означает «сын Матуса» или «потомок Матуса». Но что скрывается за этим именем?

Самая вероятная версия: Матус — это народная, разговорная форма крестильного имени Матфей (в русской традиции часто звучало как Матвей). В диалектах и бытовой речи имя Матвей могло сокращаться до Матус, Матуся, Матуха. Словообразовательная модель проста: от уменьшительного Матус через притяжательное прилагательное («чей?» — Матусев) образовалась фамилия. По этой же схеме возникли Матусевич, Матусов, Матушкин.

Есть и более редкая гипотеза, которую приводят некоторые ономасты (например, в работах по белорусской антропонимии): Матус может быть формой имени Матвей, но с польским или западнорусским влиянием, где суффикс -ус характерен для ласкательных вариантов (ср. Янус, Стасюс). Однако для фамилии Матусев это не принципиально — корень остается тем же.

Географически фамилия Матусев чаще встречается в южнорусских и украинских областях, а также среди потомков казачества. В дореволюционных переписях носители фамилии фиксировались в Курской, Воронежской и Харьковской губерниях. Это указывает на то, что предки были скорее всего крестьянами или мещанами, а не дворянами: фамилии на -ев у простого люда закреплялись именно в таком виде, без дворянских приставок и сложных суффиксов.

Интересная деталь: написание «Матусев» (через «с», а не «з») полностью соответствует правилам русской орфографии, но если бы фамилия произошла от имени Матуз (редкая форма от Матвей), мы бы видели «Матузев». Такое написание встречается, но крайне редко. Так что ваша фамилия — без вариантов, прямая и ясная: от Матуса, то есть от Матвея.