Фамилия Матусовская — женская форма фамилии Матусовский, и её разумнее рассматривать в паре с мужским вариантом, потому что именно он объясняет происхождение. Это типичная фамилия польско-украинско-белорусского ареала, образованная по модели с суффиксом -ск-/-цк-, который в XVI–XVII веках был маркером шляхетского или, шире, привилегированного сословия. Однако к XIX веку такие фамилии широко распространились среди крестьян и мещан западных губерний Российской империи, так что сословный вывод по одному суффиксу делать рискованно.

Основа фамилии — топоним Матусов или Матусово. На карте Восточной Европы таких названий несколько: село Матусов в Черкасской области Украины, деревня Матусово в бывшей Минской губернии, а также ряд исчезнувших хуторов. Все они, скорее всего, восходят к личному имени Матус — народной форме канонического имени Матфей (в латинской традиции — Матфий, в польской — Mateusz). В белорусском и украинском говорах имя редуцировалось до Матус, а суффикс -ов- указывал на принадлежность: Матусов — «относящийся к Матусу», то есть сын или владение человека с таким именем.

Таким образом, первый носитель фамилии Матусовский получил её по названию места, где жил или которым владел, — «из Матусова». В польской традиции такие фамилии часто оформлялись окончанием -ski и означали дворянское происхождение от поместья, но на восточных землях Речи Посполитой этот принцип со временем стал чисто формальным. Интересно, что в русских переписях XIX века фамилия Матусовский могла записываться и как Матусов, без суффикса, а женская форма Матусовская тогда же фиксировалась у жён и дочерей — по правилам русской грамматики, где женские фамилии на -ская были обязательны.

Встречается и более редкая версия: от прозвища Матус, которое в южнорусских говорах иногда означало «малорослый, невзрачный человек» (от диалектного «матус» — мелочь, кроха). Но это локальное значение, и для фамилии, распространённой на широкой территории от Волыни до Поднепровья, топонимическая версия остаётся основной.