Фамилия Маякина — женская форма, а её мужской вариант — Маякин. В основе почти наверняка лежит прозвище или мирское имя Маяк. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Маякин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Маяк.

Самая прямая версия — профессиональная. Маяком в старину называли не только береговой навигационный знак, но и человека, который подавал сигналы, сторожил, следил за порядком. В северных и приволжских говорах «маяк» — это ещё и шест с пучком соломы, веха, которую ставили в поле или на болоте, чтобы обозначить путь. Прозвище Маяк мог получить либо сторож на вышке, либо работник, который ставил такие вехи, либо просто видный, заметный человек — «как маяк». Встречается и другая, менее распространённая версия: в некоторых диалектах «маяк» — это удар, оплеуха («дать маяка»). Тогда прозвище могло закрепиться за драчуном или, наоборот, за тем, кто часто получал тумаки.

С точки зрения географии фамилия Маякин (и Маякина) встречается в основном в Поволжье, особенно в Нижегородской и Кировской областях, а также на Урале. Это указывает на северорусское или среднерусское происхождение, где была распространена модель фамилий на -ин от прозвищ на -а/-я.

Редкий, но интересный вариант: в некоторых местах «маяком» называли большую корзину или меру для зерна. В этом случае фамилия могла возникнуть у торговца или мельника, работавшего с такой мерой. Таким образом, предки современных Маякиных могли быть сторожами, проводниками, землемерами или людьми, чья работа была связана с заметными ориентирами на местности.