Фамилия Меденикова хранит память о прозвище дальнего предка — Меденик. В основе лежит нарицательное слово «меденик»: так называют болгарский свадебный хлеб. Этот хлеб играл важную роль в обряде: его разламывали над головами молодожёнов, что символизировало любовь и прочный союз. Свадебные меденики обильно украшали орнаментом, изображениями растений и фигурками животных, нередко вместе со свадебным деревцем — всё это олицетворяло рождение новой семьи и переход молодых в новый социальный статус.

Исходя из этого, логично предположить, что родоначальник Медениковых был пекарем, который выпекал обрядовый хлеб. Прозвище Меденик закрепилось за ним по роду занятий, а потомки со временем получили фамилию Меденикова. Суффикс -ов в мужском варианте указывает на принадлежность: «сын Меденика».

Однако есть и другой возможный след. В русских говорах слово «меденик» могло относиться к человеку, связанному с мёдом — например, к торговцу медом или пасечнику. Эта версия менее праздничная, но не менее правдоподобная: прозвища по ремеслу давали часто, и «медовый» след в фамилии выглядит естественно для регионов с развитым бортничеством. Какая из гипотез верна для конкретной семьи — сказать трудно, но обе указывают на трудовое происхождение прозвища.

Представители рода Медениковых упоминаются в Памятных книгах. Так, в Книгу памяти Тюменской области внесены Медеников Василий Кириллович (р. 1884) и Меденикова Татьяна Егоровна (р. 1882), проживавшие в деревне Нижний Яр Долматовского района Курганской области. Эта запись — редкое документальное подтверждение того, что фамилия бытовала в Зауралье, в крестьянской среде, и сохранилась там как минимум с XIX века.

Сама фамилия образована по типичной русской модели с суффиксом -ов, но исходная основа необычна: прозвищ от слова «меденик» в ономастических справочниках почти не встречается, что делает фамилию сравнительно редкой и заметной на фоне однокоренных Медников, Медведевых или Медовых.