Фамилия Мефтахутдинов — тюркская по происхождению, и её ключ лежит в арабском именнике, адаптированном в татарской и башкирской среде. Основа — мужское имя Мефтахутдин, которое состоит из двух частей: «мефтах» (от арабского «мифтах» — ключ) и «ад-дин» (вера, религия). Вместе это даёт значение «ключ веры», «отмыкающий религию» — образное имя, которое давали с надеждой, что ребёнок станет глубоко верующим человеком, знатоком ислама.

Фамилия образована по классической для региона модели: к имени Мефтахутдин прибавили русский патронимический суффикс -ов, что буквально означает «потомок Мефтахутдина». Такие фамилии массово закреплялись у татар, башкир и других народов Поволжья и Приуралья в конце XIX — начале XX века, когда начался обязательный учёт населения. До этого люди обходились именем и отчеством, а фамилия нередко фиксировалась по отцу — так имя деда или прадеда становилось родовым.

Интересная деталь: имя Мефтахутдин — не единственный вариант. В тех же кругах бытовали формы Мифтахутдин (с переходом «е» в «и» под влиянием диалектного произношения) и даже Мифтах. От них пошли однокоренные фамилии Мифтахутдинов, Мифтахов. Мефтахутдинов — более редкий, книжный вариант, где сохранился начальный «е», что может указывать на грамотную запись имени при переписи, а не на бытовое произношение.

Географически фамилия крепко привязана к Татарстану, Башкортостану и соседним регионам — Оренбургской, Челябинской, Самарской областям. Встречается она и в Средней Азии, куда предки переселялись в советское время. Носители этой фамилии, как правило, потомки крестьян, ремесленников или торговцев из мусульманских общин — никакого дворянского сословия за ней не числится, это чисто народная фамилия.

Разбор суффикса здесь простой, но показательный: -ов говорит о том, что фамилия оформлялась уже в русской административной системе. Если бы татары или башкиры записывали её на своём языке, она выглядела бы как Мефтахутдинов улы (сын Мефтахутдина). Но для документов выбрали стандартный русский патроним, что типично для подавляющего большинства фамилий этого ареала.