Фамилия Мекешина — женская форма фамилии Мекешин, и её происхождение стоит искать не в географическом названии или профессии, а в личном имени или прозвище. Основа фамилии — «Мекеш», что с большой вероятностью является производной формой от крестильного имени Мефодий (в народной речи — Мефодий, Нефёд, Мехей). В русской ономастике такие усечённые и переиначенные варианты имён — обычное дело: от Мефодия через стадии «Мехей» и «Меха» легко получить форму «Мекеш» с характерным суффиксом -еш, который мог придавать имени оттенок ласкательности или просторечия.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Мекешин буквально означает «сын Мекеша» или «человек из рода Мекеша». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на твёрдый согласный. Интересно, что фамилия Мекешина довольно редка и не имеет массового распространения. В дореволюционных источниках она фиксируется преимущественно в центральных и северных губерниях России, например, в Вологодской и Костромской, что может указывать на её исконно северорусское бытование.

Существует и менее вероятная, но возможная версия: связь с диалектным словом «мекеш» или «мекош» — так в некоторых говорах называли медлительного, нерасторопного человека. Однако это лишь гипотеза, не подкреплённая словарными данными. Более убедительным остаётся антропонимический путь: от канонического имени через народную переделку к прозвищу и затем к фамилии. Таким образом, предки носительницы фамилии Мекешина, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по имени или прозвищу своего родоначальника.