Фамилия Мельниковская происходит от прозвища Мельник, которое в старину давали человеку по его ремеслу. Основатель рода, судя по всему, владел мельницей или работал на ней, и это занятие стало его главным именем в глазах окружающих. Прозвище оказалось настолько цепким, что со временем полностью вытеснило крестильное имя и в быту, и в официальных бумагах, а затем легло в основу фамилии.

Интересно, что образ мельника в народном сознании был двойственным. С одной стороны — уважаемый мастер, без которого не смолоть зерно. С другой — человек, связанный с водяным, которому, по поверьям, мельники приносили жертвы, бросая в воду дохлых животных или хлебные крошки. Эта языческая подоплёка добавляла профессии таинственности, но на формирование фамилии она не повлияла: в её основе лежит только род занятий, а не суеверия.

Сама форма Мельниковский — это притяжательное прилагательное с суффиксом -ск-, который в русской ономастике чаще всего указывает на географическую или родовую принадлежность. В данном случае он работает иначе: не от названия места, а от личного прозвища. Такая модель встречается реже, чем привычные -ов и -ин, и говорит о более позднем, книжном оформлении фамилии. Женский вариант Мельниковская — естественное грамматическое соответствие, а не отдельная фамилия.

Не стоит путать Мельниковских с многочисленными Мельниковыми. Те образованы простым суффиксом -ов и появились раньше, в среде крестьян и посадских. Форма на -ский чаще встречалась у дворянства и духовенства, а также у выходцев из западных русских земель, где такие фамилии были привычнее. Поэтому можно предположить, что предки Мельниковских либо принадлежали к более образованному сословию, либо жили на территории современной Беларуси или Украины, откуда фамилия и пришла в великорусские губернии.

Точных сведений о конкретном родоначальнике и месте, где он жил, не сохранилось. Но сама фамилия — редкий пример того, как простое прозвище по профессии получило не простое, а «благородное» оформление, что делает её любопытным исключением среди однокоренных русских фамилий.