Фамилия Мереченкова — женская форма от Мереченков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов/-ев типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или мирских имён, оканчивающихся на согласный. В данном случае основа — Мереченок, а не Мереченко, как можно было бы предположить. Суффикс -ок (в исходном слове) часто указывал на уменьшительную или пренебрежительную форму, а в фамилиях — на прозвище человека по какому-то характерному признаку.

Корень «мереч-» — тёмный и редкий. Самая правдоподобная версия связывает его с диалектным словом «мерекать» (соображать, думать, понимать). В северных и сибирских говорах «мерека» — это толк, смысл, а «меречливый» — догадливый, сметливый. Прозвище Мереченок могли дать человеку неглупому, но с оттенком: не просто умный, а себе на уме, хитроватый. Менее вероятно, но возможно, что основа восходит к «мереща» или «мерещить» (мелькать, чудиться) — тогда прозвище мог получить человек с причудами или тот, кто видел то, чего нет.

География фамилии узкая. Мереченковы и Мереченковы (с ударением на второй слог) встречаются в основном в Поволжье, особенно в бывшей Симбирской губернии и в Мордовии. Это наводит на мысль, что фамилия могла сложиться в среде крестьян-однодворцев или служилых людей по прибору, которые несли сторожевую службу на юго-восточных рубежах. В дворянских родословных книгах фамилия не зафиксирована.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Мереков, Мерекин, Мережников — показывает, что вариант на -ченков (через суффикс -енок) встречается реже других. Это дополнительно подчёркивает, что основа Мереченок — не отчество, а именно прозвище, которое закрепилось за одним человеком и передалось его потомкам. Если бы это было отчество от имени Меречка (гипотетическая форма от Меркурий или Емельян), фамилия звучала бы как Меречкин, а не Мереченков.