Фамилия Мергенбаев образована от тюркского мужского имени Мергенбай. Первая из них восходит к имени Мерген, которое в переводе с древнетюркского означает «искусный охотник; меткий стрелок». К таким именам, очевидно, относится и имя Мергенбай. Родители могли так назвать своего ребенка в надежде, что он вырастет сильным, смелым человеком, защитником своей родины и семьи. Таким образом, потомок человека, которого звали Мергенбай, со временем получил фамилию Мергенбаев.