Фамилия Мериин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её суффикс и основу, а также вспомнить, как работала русская модель образования фамилий.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Мериин. Обычно такие фамилии образовывали от имени или прозвища отца, оканчивающегося на -а/-я. Основа здесь — Меря или Меряй. Сразу напрашивается версия, что перед нами фамилия от женского имени Марья (Мария) в диалектном произношении: в некоторых говорах «а» после мягкого согласного переходило в «я», а «р» могло отвердевать или выпадать, давая форму «Меря». Но это объяснение работает только в том случае, если фамилию дали по матери (внебрачный ребёнок или вдова), что для русских фамилий XVIII–XIX веков редкость.

Гораздо правдоподобнее, что в основе лежит мирское прозвище Меря — от названия финно-угорского племени меря, жившего на территории современных Ярославской, Костромской, Ивановской областей. В русских землях «меря» могло означать человека, происходящего из этого племени, либо того, кто жил на бывших мерянских землях и перенял какие-то местные черты. Прозвище могло быть нейтральным или даже ироничным (как «чудь», «татарин»), но со временем закрепилось в качестве фамилии. В этом случае Мериин — потомок человека по прозвищу Меря.

Есть и третья, более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть от канонического имени Меркурий (в просторечии Меркул, Меркуша). Усечённая форма Меря — вполне возможный вариант для бытового общения, как Ваня от Иван или Петя от Пётр. Тогда Мериин — «сын Мери» (Меркурия).

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку России: Вологодская, Костромская, Вятская губернии — как раз там, где исторически жила меря и где имя Меркурий было в ходу. Встречается она крайне редко, в основном в старых метрических книгах. В современном списке распространённых фамилий её нет.

С точки зрения словообразования, Мериин — типичная патронимическая фамилия с суффиксом -ин, но с необычной основой, допускающей сразу три равноправных толкования. Какое из них верное для конкретной семьи — можно понять только по генеалогии: если предки жили на мерянских землях, версия с племенем становится основной; если в роду было имя Меркурий — то вторая.