Фамилия Мершин — наглядный пример того, как русская фамилия может быть образована от краткой формы крестильного имени. В основе лежит имя Мерша — производная форма от канонического имени Меркурий (лат. Mercurius, от имени бога торговли). В народной речи имя Меркурий сокращалось до Меркуша, Мерша, а от этих форм и пошла фамилия. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Мершин, то есть сын или потомок Мерши.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с прозвищем Мерша, которое могло возникнуть от диалектного глагола «мершить» — в некоторых говорах это значило «морщить, корчить, делать недовольное лицо». В этом случае фамилия отражала бы особенность поведения или внешности первого носителя прозвища. Однако ономастика чаще фиксирует образование от личных имён, чем от редких глагольных корней, так что версия с Меркурием предпочтительнее.

Географически фамилия Мершин встречается нечасто. Основные очаги — Поволжье и центральные области России, где имя Меркурий было в ходу у крестьян и мещан. В дворянских родословных эта фамилия не отмечена, что типично для «простонародной» модели на -ин: такие фамилии закреплялись за крестьянами и посадскими людьми после отмены крепостного права, когда паспортизация коснулась всех сословий.

В написании фамилии нет вариативности: Мершин пишется через «е», а не через «ё» или «и» (Мёршин, Миршин — это уже другие фамилии, хоть и звучат похоже). Сравните с однокоренными Меркушев, Меркулов — все они восходят к одному имени, но разными суффиксами. Мершин — самая короткая и лаконичная из этого гнезда.