Фамилия Мерсиков образована от личного прозвища Мерсик — такой тип фамилий широко распространен в русской ономастике. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Мерсиков буквально значит «сын Мерсика», «потомок Мерсика». Такую модель использовали в основном в северных и центральных русских землях, где фамилии на -ов/-ев закреплялись с XV–XVI веков, а окончательно утвердились после отмены крепостного права.

С происхождением самого прозвища Мерсик есть две правдоподобные версии, и обе заслуживают внимания.

Первая связывает прозвище с сибирским названием форели — мерсовик. Если это так, то Мерсиком называли рыболова, и фамилия относится к «профессиональным» именованиям, указывающим на род занятий. В Сибири, где форель водилась в изобилии, прозвище могло закрепиться за человеком, чей промысел был хорошо известен окружающим. Вторая гипотеза ведет прозвище к французскому merci — «спасибо». Так могли назвать человека, который, желая угодить, постоянно благодарил. Эта версия менее вероятна: французские заимствования в народной речи появились поздно, в XVIII–XIX веках, и вряд ли стали бы основой для устойчивого деревенского прозвища. К тому же в русских говорах слово «мерси» фиксируется как разговорное, но прозвищ от него почти не образовывали. Поэтому версия с рыболовством выглядит убедительнее.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования фамилий растянулся на несколько столетий, а письменные источники по таким «простым» прозвищным фамилиям отрывочны. Но сама фамилия Мерсиков — живой памятник русской прозвищной традиции, где за каждым именем стоит конкретный человек с его занятием или особенностью характера.