Фамилия Мерушев — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она относится к пласту фамилий, образованных от прозвищ или дохристианских имён, и её основа — Меруш.

Чтобы понять корень, нужно отбросить типичный русский фамильный суффикс -ев (вариант -ов после мягкого согласного). Основа Меруш- восходит к имени или прозвищу Меруш. Самая вероятная версия: Меруш — это уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Меркурий (или Меркул, народная форма). В старину полные имена сокращали до коротких обиходных вариантов: Меркурий превращался в Меру, Меруша, а отсюда уже и Меруш. Суффикс -уш- характерен для русской народной традиции (ср. Петруша, Ванюша, Митюша). Таким образом, Мерушев буквально означает «сын Меруша», то есть потомок человека, которого в быту звали Мерушей.

Есть и вторая, менее распространённая версия, связанная с географией. В некоторых говорах «меруша» могло быть прозвищем человека, занимавшегося межеванием, измерением земли (от «мерить»). Однако это предположение слабее: слово «меруша» в значении «землемер» не зафиксировано в словарях как устойчивое, а прозвища от глаголов обычно образовывались иначе (Мерило, Мерник). Поэтому версия с именем Меркурий выглядит гораздо убедительнее.

Суффикс -ев указывает на то, что фамилия сформировалась в среде великорусского населения, скорее всего, не на юго-западных землях (где преобладал суффикс -ич или -енко), а в центральных или северных регионах России. Фамилия недворянская, типичная для крестьян и мещан: такие «полуотчества» от уменьшительных имён давали в среде, где было много однофамильцев с одинаковыми полными именами, и нужно было точнее идентифицировать человека по отцу.

Интересно, что фамилия Мерушев — редкий пример сохранения старой народной формы церковного имени, которая почти вышла из употребления. В то время как фамилии Меркулов, Меркурьев встречаются часто и образованы от полной формы, Мерушев стоит особняком, напоминая о том, как в деревне называли человека по-свойски, а не по святцам.