Основой фамилии Меркушев послужило имя Меркуша. Фамилия Меркушев восходит к имени древнеримского бога, покровителя торговли — Меркурий, который изображался с крылышками на ногах. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Меркуша, со временем получил фамилию Меркушев.