Фамилия Меркушева ведет начало от крестильного имени Меркурий. Так звали древнеримского бога — покровителя торговли, которого изображали с крылышками на ногах. Однако в христианской традиции имя закрепилось благодаря другим носителям: в III веке за веру пострадал великомученик Меркурий, а в XIII веке это имя принял монах, ставший смоленским епископом. Именно в память о последнем на Руси крестили Меркуриями множество простых крестьянских мальчиков.

В народной среде полное церковное имя быстро переделали в более удобные для повседневной речи формы. Меркурия звали Меркулой, а чаще — Меркушей. Такое уменьшительное имя и легло в основу фамилии. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Меркушева буквально означает «дочь (или жена) Меркуши». Так что первым носителем фамилии был человек, которого в округе знали под именем Меркуша, а его потомки уже закрепили это прозвище как родовое.

Любопытно, что исходное имя, несмотря на языческое происхождение, органично вошло в православные святцы. Поэтому фамилия Меркушева — не редкая, она встречается в разных регионах России, особенно там, где было распространено имя Меркурий. В написании возможны варианты: Меркушев (для мужчин) и Меркушева (для женщин), а также родственные фамилии вроде Меркулов, Меркурьев — все они образованы от разных народных форм одного и того же имени.