Фамилия Мигдальник — одна из тех, что сразу указывает на занятие или характерный признак предка. Её основа — слово «мигдаль» или «мигдал». В польском языке «migdał» означает «миндаль». В украинских и белорусских говорах «мигдаль» или «мигдал» — то же самое, миндальный орех. Суффикс -ник в восточнославянских фамилиях часто обозначает человека по роду деятельности: лесник, рыбник, мельник. Соответственно, Мигдальник — это тот, кто имеет отношение к миндалю. Самое прямое толкование: торговец миндалём, садовод, выращивающий миндальные деревья, или же кондитер, который использовал миндаль в выпечке. Миндаль на Руси был продуктом привозным и дорогим, поэтому прозвище могли дать человеку зажиточному, торговавшему на ярмарках южными сладостями и орехами.

В польской ономастике есть фамилия Migdal и Migdalski. Наш вариант, Мигдальник, — скорее восточнославянский, с характерным суффиксом -ник. Встречается он в основном на западе Украины, в Подолье, на Волыни, а также в южных регионах Беларуси — там, где исторически было сильно польское влияние и где еврейское население активно занималось торговлей, в том числе бакалейной. В еврейской среде фамилия Мигдальник также распространена: идишское «мигдал» означает «миндаль», и фамилия могла быть прозвищной или искусственной, данной при переписях в черте оседлости.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с топонимом. В Литве и Польше есть местечки Мигдалы, Мигдалово. Выходец из такого селения мог получить фамилию Мигдальник, то есть «житель Мигдалов». Однако в этом случае фамилия чаще звучала бы как Мигдаловский или Мигдальский. Поэтому основная версия — профессиональная или прозвищная, от миндаля.

С точки зрения словообразования фамилия проста: корень мигдаль- плюс суффикс -ник. Ударение почти всегда падает на второй слог: Мигда́льник. Вариант с ударением на первый слог встречается реже, но и он возможен в некоторых регионах. Фамилия недвусмысленная, без спорных окончаний, и сразу даёт понять, чем занимался или чем славился первый носитель.