Фамилия Мигунова образована от прозвища Мигун. Так могли называть человека, который часто моргает или подмигивает. Возможно, что прозвище Мигун получил также игривый, легкомысленный человек. Эту фамилию носил известный советский, российский художник-мультипликатор, иллюстратор и карикатурист Евгений Тихонович Мигунов, который иллюстрировал сериалы Александра Волкова об Изумрудном городе, Кира Булычёва об Алисе Селезнёвой, Евгения Велтистова об Электронике и книгу Стругацких «Понедельник начинается в субботу». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мигун, со временем получил фамилию Мигунова.