Фамилия Миханошин — редкий случай, когда в основе лежит не имя, а прозвище, образованное от глагола «миханить». В русских говорах слово «миханить» означало «обманывать, плутовать, хитрить». Соответственно, Миханоша — это прозвище хитрого, изворотливого человека, ловкача. Такие прозвища давали не обязательно с осуждением: в крестьянской среде умение выкрутиться из трудной ситуации часто ценилось как практическая сметка.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Миханошин буквально значит «сын Миханоши», то есть потомок человека с таким прозвищем. Модель образования типична для северных и центральных русских областей, где фамилии на -ин широко распространены. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от названий профессий или отчеств на -ович, здесь мы видим прямую связь с личным прозвищем.

Интересно, что фамилия не имеет отношения к имени Михаил, хотя внешне похожа. Если бы основа была от имени, мы бы имели форму Михайлов или Михалин. Редкий корень «михан-» встречается и в других фамилиях: Миханов, Миханкин, но Миханошин стоит особняком из-за суффикса -ош-, который придаёт прозвищу чуть пренебрежительный или уменьшительный оттенок.

Географически фамилия тяготеет к Вологодской и Архангельской областям, где диалектное слово «миханить» фиксируется в говорах. Это подтверждает, что предки Миханошиных были, скорее всего, крестьянами или ремесленниками Русского Севера. В дореволюционных переписях фамилия встречается редко, что говорит о её локальном характере.

Есть и менее вероятная версия: связь с тюркским корнем «михан» — гость, путник. Но в русской ономастике она не находит убедительных подтверждений, так как фамилия не имеет типичных тюркских суффиксов и не встречается в регионах активных контактов с тюрками. Надёжнее остановиться на версии с прозвищем: она объясняет и семантику, и словообразование, и ареал бытования.