Фамилия Михайлюто — редкий пример того, как украинская уменьшительная форма имени превратилась в фамилию, застывшую в своём исходном виде. В основе лежит каноническое имя Михаил (от древнееврейского «кто как Бог»), а суффикс -ют-о указывает на ласкательное или пренебрежительное обращение. В украинской ономастике такая модель встречается нечасто: обычно от имён образуют фамилии на -енко или -ук, но форма на -юто (как, скажем, Иванюто или Грицюто) характерна для западных регионов — Волыни, Подолья, а также для белорусского Полесья.

Словообразовательная цепочка проста: Михайло (народная форма имени) → Михайлюта (уменьшительное) → Михайлюто. Фамилия не склоняется и не меняет окончания, что типично для украинских фамилий на -о, закрепившихся в письменной традиции. Если бы фамилия возникла в русской среде, она, скорее всего, получила бы суффикс -ов (Михайлютов), но украинский вариант сохранил исходную форму прозвища.

Первые носители фамилии — скорее всего, крестьяне или казаки, которых в быту называли «Михайлюто» (то есть «маленький Михайло», «Михайлик»). В метрических книгах XIX века такая фамилия встречается в основном на территории Волынской и Киевской губерний. Позже часть носителей переселилась в Сибирь и на Дальний Восток в ходе столыпинской аграрной реформы, поэтому сегодня Михайлюто можно встретить не только на Украине, но и в российских регионах — от Краснодарского края до Приморья.

Интересная деталь: фамилия сохранила архаичное ударение на второй слог — Михайлю́то, хотя в разговорной речи иногда смещают ударение на первый слог под влиянием русского языка. В словарях украинских фамилий (например, в работах Ю. Редько) такая форма фиксируется как редкая, но устойчивая, без вариантов написания. Это значит, что предки носителей фамилии, скорее всего, жили компактно и не подвергались массовой «русификации» окончаний.