Фамилия Михейков образована от имени Михейко — народной формы крестильного имени Михей. Михей, в свою очередь, это русская версия древнееврейского имени Миха, которое переводится как «тот, кто подобен Богу». В православных святцах имя Михей встречается редко, но оно давалось в честь одного из двенадцати малых библейских пророков. Таким образом, в основе фамилии лежит не прозвище, не профессия, а церковное имя, что типично для огромного пласта русских фамилий.

Суффикс -ов указывает на стандартную модель образования патронима: Михейко → сын Михейка → Михейков. Форма Михейко (с окончанием -о) характерна для западных и южных русских говоров, а также для украинского и белорусского языков. В центральной России чаще звучал бы вариант Михейкин (от Михейка). Поэтому фамилия Михейков может указывать на географические корни предков: скорее всего, они происходили из территорий, где было принято смягчать имена на -ко (Смоленщина, Брянщина, Псковщина, Белоруссия, Украина).

В ономастике фамилия Михейков интересна тем, что она стоит в одном ряду с более частыми Михеевым и Михеичевым, но образована от другой, уменьшительной, формы имени. Если Михеев — прямой патроним от полного имени Михей, то Михейков — «внучий» вариант, через промежуточную ступень Михейко. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был не просто Михеем, а именно Михейком — так в быту могли называть младшего в семье, подростка или просто человека невысокого роста, но это не прозвище, а именно ласкательная форма имени.

Встречаемость фамилии невысокая. Она не входит в число распространённых, но чётко локализована: по данным современных телефонных справочников и баз, носители Михейковых чаще всего фиксируются в Смоленской, Брянской областях и в Беларуси. Это подтверждает гипотезу о западнорусском происхождении. В дореволюционных документах фамилия могла записываться по-разному: через «и» или «ы» (Михейков и Мыхейков), но каноническим считается написание через «и» от имени Михей.