Основой фамилии Михонов послужило имя Михоня. Фамилия Михонов восходит к крестильному мужскому имени Михаил, которое в переводе с древнееврейского означает «благонравный». Производная форма этого имени – Михоня – распространена в Белоруссии, на Украине и в Румынии. Это имя носил небезызвестный архангел Михаил — главный архангел, являющийся самым почитаемым библейским персонажем. На иконах он часто изображается с тростью-копьём в одной руке и особой сферой-зерцалом (символ предвидения, переданного Архангелу Богом) в другой. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Михоня, со временем получил фамилию Михонов.