Фамилия Микитишина — женская форма, мужской вариант которой Микитишин. Это типичная «патронимическая» фамилия, образованная от имени или прозвища отца через суффикс -ин (в мужском роде — -ин, в женском — -а). Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Микитишин, то есть «сын Микитиши». В основе лежит имя Микитиш — это разговорная, народная форма канонического имени Никита.

Имя Никита (греч. Nikētēs — «победитель») в русской традиции давало множество производных: Никитка, Микита, Микитка, Микитушка. Форма Микитиш — это уже отчество второго порядка: от Микиты (или Микитки) образовывали Микитич, а от него — уменьшительно-ласкательное Микитиш. Таким образом, Микитишин буквально означает «внук Микиты», а точнее — «потомок того, кого звали Микитиш».

Географически фамилия Микитишина встречается преимущественно в центральных и южных областях России, а также на Украине, где аканье (произношение «и» как «ы» или замена «н» на «м» в начале слова) было распространено. В украинском языке имя Никита часто звучало как Микита, отсюда и целое гнездо фамилий: Микитенко, Микитюк, Микитин, Микитишин. Русский вариант Микитишин — результат обрусения украинской основы или самостоятельного диалектного произношения.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще носили крестьяне и служилые люди, фамилии на -ин в центральной России были характерны для разных сословий, но особенно для жителей северных и центральных губерний, где сохранялась старая модель образования от имени с суффиксом -ин. Микитишины могли быть и крестьянами, и мещанами, и духовенством — точных данных о преобладании какого-то одного сословия нет, но сам тип фамилии указывает на то, что предок был рядовым человеком, которого в быту звали не по фамилии, а по отцу: Микитиш.

Стоит заметить, что написание с «и» в первом слоге (Микитишина, а не Никитишина) — не ошибка, а отражение реального произношения в тех местах, где фамилия возникла. В документах XIX — начала XX века можно встретить и вариант Никитишин, но Микитишин — более редкая и диалектно окрашенная форма, сохранившая живое народное звучание.