Фамилия Милованкины хранит в себе редкий для современных русских фамилий суффикс, который сразу выдает её старинное происхождение. В то время как большинство русских фамилий образовано с помощью суффиксов -ов или -ин, здесь мы видим цепочку: основа Милованка + суффикс -ин. Это означает, что фамилия пошла не от отца, а напрямую от прозвища или имени Милованка, которое носил родоначальник.

Само прозвище Милованка восходит к прилагательному «милый» со значением «дорогой, желанный; привлекательный, хорошенький; нежный, кроткий». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище содержало указание как на особенности внешности основателя фамилии (миловидность, красота), так и на черты его характера (добродушность, незлобливость, кротость). Такие «ласкательные» прозвища были типичны для древнерусской традиции: они подчеркивали не статус человека, а его душевные качества или то, как к нему относились окружающие.

Согласно другой гипотезе, в основе фамилии лежит не прозвище, а мирское имя Милованка — так могли назвать долгожданного, желанного, любимого ребенка. В дохристианской и раннехристианской традиции такие имена-обереги давали детям, чтобы через имя передать им пожелание счастливой и «милой» жизни. Наконец, не исключено, что фамилия образована от имени Милованка как производной формы мужского старославянского имени Милован — «ласкающий, заботливый». В этом случае Милованка — это уменьшительно-ласкательный вариант, который со временем закрепился как самостоятельное имя.

Родственные именования встречаются в исторических документах. В труде С. Б. Веселовского записаны Милован Данилович Подымов (1577 г., Рязань) и Булгак Милованов, Лазарь Евстафьев, дьяк Казенного двора (1613 г.). Эти записи показывают, что корень «милован-» был в ходу в XVI–XVII веках и в боярской, и в приказной среде. Любопытно, что форма Милованкин, а не Милованов, говорит о более тесной связи с конкретным человеком — вероятно, предок был известен в своей округе именно как Милованка, и это имя перешло на его потомков без промежуточной ступени.

Фамилия Милованкины — самобытный памятник славянской культуры, но процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности. Окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований, однако уже сейчас ясно: за ней стоит тёплое, человеческое прозвище, которое давали человеку с добрым сердцем или желанному ребенку.