Фамилия Миляхова — женская форма от мужской Миляхов, и её происхождение неочевидно даже для привычного уха. На первый взгляд кажется, что в основе лежит имя Миля или Миляха — ласкательное от Дмитрий, Емельян или Михаил (ср. Миля, Миляня, Миляша). Но суффикс -их- в русских фамилиях встречается редко и указывает на иную модель: фамилии на -ихов (как Глазков, Поляков) обычно вторичны, то есть образованы от прозвища или имени, которое уже имело окончание -их. Проще говоря, Миляхов — это «чей?» — сын Миляха, где Милях — самостоятельное прозвище, а не сокращение.

Что могло значить это прозвище? В русских говорах слово «миляха» (или «миляк») означало милого, приятного человека, любимца. Но есть и другая, более приземлённая версия: в некоторых областях «миляхой» называли ленивого или изнеженного человека, того, кто «милуется», не хочет работать. Такое прозвище могли дать иронично — как часто бывает, за противоположное качество. Третья возможность — топонимическая: фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта вроде Миляхово или Миляхи, но таких топонимов в современных атласах почти нет, и эта версия остаётся лишь предположением.

Географически фамилия Миляхова не привязана к какой-то одной области — она встречается и в центральных регионах, и на юге России, но везде достаточно редка. Это говорит о том, что род, скорее всего, не был многочисленным и не дал массового распространения. С социальной точки зрения носители фамилии могли быть крестьянами или мещанами: прозвищные фамилии на -ов/-ев в этой среде появлялись позже, в XVIII–XIX веках, и часто фиксировали именно бытовое, неофициальное имя человека.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Миляев, Миляков, Милягин) показывает, что ударение в исходном прозвище падало на второй слог: Миля́х, Миля́ха. В современной фамилии ударение чаще ставят на первый слог (Ми́ляхова), но в документах встречаются варианты — это естественная неустойчивость для редкой фамилии. Таким образом, Миляховы — потомки человека, которого в округе звали Милях, то есть либо «милый, ласковый», либо, с насмешкой, «неженка». Какая из этих версий верна для конкретной семьи, без генеалогического исследования не узнать, но обе укладываются в живую логику русских прозвищ.