Фамилия Миндеева — это женская форма фамилии Миндеев, а та, в свою очередь, образована от личного имени или прозвища Миндей. Такая модель типична для русских фамилий: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?» — из рода Миндея), а само имя-основа встречается в нескольких версиях.

Наиболее вероятное объяснение — тюркское происхождение. Имя Миндей могло восходить к слову «менди», что значит «гора», или к близким по звучанию основам со значением «вечный», «постоянный» (сравните с тюркскими именами на «мен-», «мин-»). Такие имена часто давали детям в татарской, башкирской или казахской среде, а потомки носителей этих имен, переходя в русскоязычную среду, сохраняли их в фамилиях. В этом случае Миндеевы — род, чей предок носил имя, связанное с горной местностью или пожеланием долголетия.

Вторая гипотеза связывает фамилию не с личным именем, а с местом жительства. В Нижнеилимском районе Иркутской области существует посёлок Миндей. Выходцы из таких поселений нередко получали прозвище по названию родной деревни, и тогда фамилия Миндеев буквально означает «приехавший из Миндея». Эта версия выглядит правдоподобной для сибирской ветви рода, однако она объясняет происхождение лишь части носителей, тогда как тюркская основа имени встречается шире.

Интересно, что фамилия Миндеева в разных регионах может иметь разную историю. В Поволжье и на Урале, где сильно тюркское влияние, вероятнее первая версия. В Сибири, особенно в Иркутской области, чаще вспоминают о посёлке Миндей. Обе линии могли существовать независимо друг от друга и лишь случайно совпасть в написании.

Процесс закрепления фамилий у разных сословий растянулся на несколько столетий. Крестьяне и мещане центральной России получали постоянные фамилии в основном после отмены крепостного права в 1861 году, а в Сибири, где не было крепостничества, фамилии могли складываться раньше и естественнее — из уличных прозвищ и отчеств. Поэтому точно сказать, когда именно возник род Миндеевых, можно только по итогам генеалогического исследования: изучения метрических книг, ревизских сказок и переписей.

Если говорить о словообразовании, фамилия Миндеева необычна тем, что у неё нет распространённого русского корня. Это не отчество от крестильного имени, как Иванов или Петров, а скорее фамилия-прозвище, отражающая либо личное качество предка, либо его географическое происхождение. В русской ономастике такие фамилии встречаются реже, поэтому Миндеевы — это род с заметным тюркским или региональным следом, и обе версии происхождения заслуживают внимания при составлении семейного древа.