Фамилия Минликаев образована от имени Минликай, представляющего собой фонетический вариант имени Минлекай. Оно образовано от татарского нарицательного «минле» со значением «тот, кто имеет родинку». Компонент –кай представляет собой уменьшительно-ласкательный аффикс, который используется при образовании имен. Вероятно, родители назвали Минликаем ребенка, который имел крупную родинку на видном месте. Таким образом, потомок человека, которого звали Минликай, со временем получил фамилию Минликаев.