Фамилия Мисанчук — характерный пример украинской модели фамилий на -чук. Этот суффикс в ономастике считается патронимическим: он указывает на сына или потомка человека, чьё имя или прозвище легло в основу. То есть Мисанчук — это буквально «сын Мисана» или «потомок Мисана». Такие фамилии массово формировались на западе Украины, особенно в Волынской, Ровенской, Хмельницкой и Житомирской областях, а также на юго-востоке Польши (Подляшье). Учитывая ареал бытования, можно предположить, что фамилия Мисанчук имеет волынские или подольские корни.

Основа фамилии — личное имя Мисан. Это неканоническая, народная форма. Скорее всего, она восходит к крестильному имени Михаил, которое в украинском просторечии давало множество вариантов: Мисько, Мисюра, Мисак, Мисан. Уменьшительно-ласкательный суффикс -ан (как в Петран, Степан) превращал Михаила в Мисана. Вторая версия, менее вероятная, — связь с польским словом misa (миска) или misaństwo (мещанство), но прозвище «Миска» вряд ли дало бы такую устойчивую патронимическую фамилию. Работает принцип «бритвы Оккама»: проще объяснить фамилию через распространённое имя, чем через редкое прозвище.

В письменных источниках фамилия встречается с XIX века. Например, в метрических книгах села Великая Омеляна (Волынская губерния) за 1870-е годы упоминаются крестьяне Мисанчуки. Сословно это были в основном крестьяне или мещане — украинская фамилия на -чук редко указывает на дворянство, если только не встречается в шляхетских списках (что для Мисанчук не характерно). В советское время фамилия распространилась по всей Украине и России из-за миграций.

Стоит обратить внимание на ударение: в фамилии Мисанчук оно, скорее всего, падает на второй слог (Мисанчу́к), как в большинстве украинских фамилий на -чук. Встречаются варианты написания через «ы» (Мисанчук) и редко через «и» (Мисанчук), но второй вариант неверен для украинской орфографии — правильное написание через «и». Фамилия не имеет отношения к румынскому или молдавскому языкам, хотя суффикс -ук встречается и там — в данном случае он однозначно украинский.