Фамилия Миселя — редкий случай, когда написание выдаёт географию точнее, чем корень. Окончание -я, а не -а, сразу указывает на западный славянский ареал: скорее всего, украинский, белорусский или польский, где фамилии на -я встречаются часто. В русской традиции такая форма почти не встречается, и если носитель живёт в центральной России, перед нами, вероятно, потомок переселенца с запада.

Основа фамилии — Мисель. Это может быть производное от имени Мисаил (церковное, еврейского происхождения, означает «испрошенный у Бога»). В народной речи Мисаил превращалось в Мисей, Мися, отсюда и Мисель — уменьшительно-ласкательная форма. Вторая версия, менее очевидная, но возможная в польском контексте: Мисель — вариант фамилии Mysiel или Myszel, связанной с прозвищем «мышь» (mysz). Однако ударение в фамилии Миселя чаще падает на второй слог (Мисе́ля), что ближе к имени Мисаил, чем к «мышиному» корню.

Суффиксальная модель у фамилии неклассическая: она не заканчивается на -ов, -ин или -ский, а представляет собой форму родительного или именительного падежа с окончанием -я. В украинской ономастике так часто оформляли фамилии от имён (Миселя — буквально «сын Миселя» или «из рода Миселя»). В польской традиции похожая конструкция (Misiula, Misiela) тоже встречается, но реже.

Географически фамилия Миселя встречается в основном в западных областях Украины (Волынь, Ровенщина, Львовщина), а также в Беларуси (Брестская область). В России единичные носители живут в Москве и Санкт-Петербурге — результат миграций XX века. Сословно предки, скорее всего, были крестьянами или мещанами: фамилия не дворянская и не купеческая, её оформление говорит о народной среде.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Миселя стоит особняком. Более частые варианты — Мисеев, Мисеичев, Мисаилов — образованы по стандартной русской модели. Миселя же сохранила архаичную западнославянскую форму, которая не поддалась унификации при переписях. Это делает фамилию маркером конкретного региона и культурного слоя.