Фамилия Мишакин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Мишакин послужило мирское имя Миша. Фамилия Мишакин восходит к крестильному мужскому имени Михаил (в переводе с греческого – «богоравный»), а точнее от его уменьшительной формы – Миша. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Миша, со временем получил фамилию Мишакин. О точном месте и времени возникновения фамилии Мишакин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мишакин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.