Фамилия Мишатин образована от имени Мишата, народной формы крестильного мужского имени Михаил, которое в переводе с древнееврейского языка означает «благонравный». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мишата, со временем получил фамилию Мишатин.