Фамилия Мишатин напрямую отвечает на вопрос, кем был её первый носитель: это потомок человека по имени Мишата. Само имя Мишата — живая, народная форма канонического крестильного имени Михаил, которое пришло на Русь вместе с христианством из древнееврейского языка. В переводе Михаил означает «благонравный» или, в более распространённой трактовке, «тот, кто подобен Богу». Однако в быту, в крестьянской и посадской среде, полное церковное имя почти не использовали. Вместо него звучали уменьшительные и обиходные варианты, и Мишата — один из них.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная. Суффикс -ата (как в именах Гаврила, Данила) придавал имени оттенок просторечия и фамильярной ласки. А вот фамильный суффикс -ин указывает на принадлежность: Мишатин буквально означает «сын Мишаты», «ребёнок Мишаты». Такая модель типична для северных и центральных русских земель, где имена на -ата были особенно распространены. Кстати, от той же основы возникли и другие фамилии: Мишатов, Мишагин, а также более редкие Мишаткин — все они держатся на одном корне, но расходятся в суффиксах.

Интересно, что имя Мишата не было строго крестьянским. В древнерусских грамотах XV–XVI веков встречаются и посадские люди, и мелкие служилые с таким именем. Например, в новгородских писцовых книгах упоминаются крестьяне Мишата и их дети, которые уже могли писаться Мишатиными. То есть фамилия закрепилась тогда, когда имя превратилось в прозвание рода, а затем — в наследственное семейное имя.

Споров о происхождении основы почти нет: версия с Михаилом — единственная убедительная. Иногда пытаются связать Мишатина с глаголом «мишать» (мешать, препятствовать) или с диалектным словом «мишатый» (неуклюжий, медлительный), но эти гипотезы слабые. Во-первых, такие прозвища редки и не дали бы устойчивой фамилии. Во-вторых, имя Мишата зафиксировано в источниках задолго до появления фамилий, и именно от него логичнее всего образовалась фамилия. Так что человек по фамилии Мишатин может с уверенностью считать своим дальним предком того самого Мишату, которого в церковных книгах записали бы Михаилом.