Фамилия Мишатина — яркий пример того, как русская фамилия может хранить в себе сразу две возможные истории, и обе ведут в крестьянскую или мещанскую среду. Основа здесь — мужское имя или прозвище Мишата. Это не просто уменьшительная форма от Михаил (через Миша), а именно разговорный, даже простонародный вариант, который в старину был вполне самостоятельным именем. Суффикс -ата (сравните: Иван → Иванята, Федор → Федята) в русской антропонимии указывал на принадлежность: Мишата — это «маленький Миша» или, шире, «сын Миши». Соответственно, Мишатина — буквально «дочь Мишаты» или «жена Мишаты». Фамилия образована по самой распространенной в России модели на -ин, которая закрепилась за словами, оканчивающимися на -а или -я.

Есть, однако, и вторая, менее очевидная, но вполне реальная версия. В северных и центральных говорах России словом «мишатый» (или «мишастый») называли медведя — ласково, по аналогии с именем Миша. В таком случае прозвище Мишата мог получить человек, чем-то напоминавший медведя: неуклюжий, косолапый, либо, наоборот, сильный и могучий. Эта версия не противоречит первой, а дополняет её: фамилия могла возникнуть и от мирского прозвища, и от крестильного имени, причём в народном сознании эти два смысла часто сливались.

Географически фамилия Мишатина не привязана к какой-то одной губернии, но чаще встречается в регионах, где были распространены говоры с характерным окончанием -ата: это Поволжье, Вятка, северные области. Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или мещанам — в дворянской среде такие «простые» формы на -ата почти не встречались. Интересно, что фамилия сохранила ударение на второй слог (Миша́тина), что тоже говорит о её народном, не книжном происхождении: в литературном языке ударение падало бы на первый слог (Ми́шатина).

Если сравнивать Мишатину с однокоренными фамилиями, то она стоит в одном ряду с Мишагиным, Мишаковым, Мишаниным. Все они образованы от вариантов имени Михаил, но суффикс -ата выделяет именно Мишатину как более старую, архаичную форму. В современных справочниках эта фамилия не слишком распространена, но её носители могут с уверенностью сказать: их предки жили в среде, где имя Мишата было обычным делом, а не книжной редкостью.