Фамилия Мишенин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Мишенин послужило мирское имя Миша. Фамилия Мишенин образована от крестильного имени Михаил, в переводе с древнееврейского «богоравный». Однако полная форма этого имени даже в XVIII в. оставалась достоянием только церкви и торжественных документов. Повседневно же употреблялись краткие Михайла, Михайло или Миша. Имена Михаил, Михайло, Михайла в XVII - XIX вв. были одними из самых частых. На протяжении веков от них образовалось целое "гнездо" родственных фамилий, занявшее одно из первых мест по употребительности. По подсчетам Б.Унбегауна, подобные фамилии в Петербурге в 1910 г. занимали пятое место, уступая только Ивановым, Васильевым, Петровым и Смирновым. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Миша, со временем получил фамилию Мишенин. О точном месте и времени возникновения фамилии Мишенин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мишенин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.