Фамилия Мишкорудная — редкая, составная и почти наверняка украинского происхождения. Её основа — сложение двух корней: «Мишк-» (уменьшительная форма имени Михаил, то есть Мишко) и «-руд-» (от слова «руда» или «рудый» — рыжий, красный). Вторая часть могла указывать либо на цвет волос («рудый»), либо на занятие, связанное с добычей руды или работой с металлом. Таким образом, первичное прозвище Мишкоруд могло означать «рыжий Мишка» или «Мишка-рудокоп».

Суффикс «-н-» и окончание «-ая» — типичный для восточнославянских фамилий адъективный формант, отвечающий на вопрос «чей?» или «какой?». В украинской традиции такие фамилии на «-ний», «-на» нередко давались по прозвищу отца: Мишкорудный, а в женском роде — Мишкорудная. В русском языке фамилия сохранила окончание женского рода, что может говорить о том, что она закрепилась за женщиной (вдовой или дочерью) или что носительница фамилии — женщина. В мужском варианте фамилия звучала бы как Мишкорудный.

Географически фамилия тяготеет к западно- и центральноукраинским землям, где распространены сложные прозвища, образованные от имени и приметы. Встречается она редко: в современных базах данных — единичные записи в Черкасской, Винницкой и Киевской областях. В России почти не фиксируется, что подтверждает её узкорегиональный характер.

Словообразовательная модель «имя + признак» (Мишко + рудый) характерна для народной ономастики XVI–XVIII веков, когда прозвища давали не по профессии, а по внешности или характеру. В отличие от фамилий на «-енко» или «-ук», которые указывали на сына (чей?), адъективные фамилии на «-ный» чаще описывали самого человека: Мишкорудный — «тот, кто Мишко-рыжий». Со временем прозвище закрепилось за потомками как фамилия, а окончание «-ая» могло возникнуть при записи в метрических книгах, где форму женского рода давали всей семье по имени матери или вдовы.