Фамилия Мишкорудников — одна из тех, где на слух угадывается составное прозвище, но при ближайшем рассмотрении не всё так очевидно. В ней два отчётливых корня: «Мишк-» (от имени Михаил в форме Мишка) и «-рудник-» (от слова «рудник»). Соединительная гласная «о» и суффикс -ов- указывают на типичную модель образования русских фамилий от прозвища или отчества, но с необычной двухосновной конструкцией.

Первая и наиболее вероятная версия: прозвище Мишкорудник принадлежало человеку по имени Михаил, который работал на руднике или жил рядом с ним. В таком случае «Мишка» — это не уничижительная форма, а бытовое, обиходное именование, которое в XVI–XVII веках свободно использовалось в документах наравне с полным именем. Сложносоставные прозвища с первым личным именем и вторым — родом занятий — встречаются, хотя и реже, чем фамилии от одного корня. Примерно по той же модели образованы, скажем, Ивановральщиков или Петрозолотарев, но они единичны.

Вторая версия, менее убедительная, связывает первую часть не с именем, а с глаголом «мишкать» (медлить, мешкать) — в некоторых говорах так называли медлительного человека. Однако глагол этот редок, а сочетание «Мишкорудник» в значении «медлительный рудокоп» выглядит натянуто. Скорее всего, перед нами именно именная основа.

Фамилия Мишкорудников — редкая. Её география тяготеет к Уралу и Сибири, где с XVIII века активно развивалась горнодобывающая промышленность. Предки носителя фамилии с высокой вероятностью были приписными крестьянами или мастеровыми на казённых или частных рудниках. Суффикс -ов- в конце указывает на то, что фамилия закрепилась как отчество: «чей? — Мишкорудников сын». Сословно это, скорее всего, крестьянская или рабочая фамилия, без дворянского корня.

С точки зрения словообразования интересен редкий для фамилий соединительный гласный «о» внутри сложной основы. Обычно в русских фамилиях от двух слов первая часть стоит в родительном падеже (Мишк-и-н, Рудн-и-ков), но здесь она сохранила именительный падеж: Мишка + рудник. Это архаичная черта, характерная для живых прозвищ, которые ещё не успели «причесать» под стандартную модель.