Фамилия Мишугин — одна из тех, где на первый взгляд ясно, откуда корни, но при ближайшем рассмотрении открывается любопытная деталь. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Мишугин, то есть сын или потомок Мишуги. Основа здесь — имя или прозвище Мишуга.

Самое вероятное объяснение: Мишуга — это уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Михаил. В народной речи Михаил превращался в Мишу, а суффикс -уга (как в Ванюга, Петруга) давал фамильярный, даже слегка грубоватый оттенок. Так Мишуга могло быть домашним прозвищем Михаила, особенно в северных и центральных говорах, где такие формы были в ходу. Подтверждение этому находим в словаре русских фамилий Б. Унбегауна, где подобные образования от Михаила (Мишук, Мишуткин) описаны как типичные.

Но есть и другая, менее очевидная версия. В некоторых русских говорах слово «мишуга» могло означать «непоседа», «егоза» или «тот, кто мельтешит, суетится». Если это так, то фамилия пошла не от имени, а от прозвища по характеру — человека подвижного или беспокойного. Однако эта версия слабее: во-первых, такое значение слова не зафиксировано в авторитетных диалектных словарях как общераспространённое, во-вторых, связь с Михаилом лежит на поверхности и встречается в сотнях фамилий (Мишуков, Мишутин, Мишагин). Поэтому основным источником фамилии Мишугин стоит считать имя Михаил.

Интересно, что фамилия эта нечастая и имеет довольно узкую географию. По данным современных исследований, она наиболее характерна для центральных областей России — в первую очередь для Тверской, Ярославской и Владимирской губерний. Там, в крестьянской среде, имя Михаил было одним из самых популярных, а его производные формы дали жизнь множеству фамилий. Мишугины, скорее всего, были потомками крестьянина или ремесленника, которого в быту звали Мишугой — безо всякого пренебрежения, а просто по-свойски.