Фамилия Мишустова — женская форма фамилии Мишустов. Её основа, скорее всего, восходит к прозвищу или мирскому имени Мишуст. В русских говорах слово «мишуст» или «мишустый» могло означать нечто пушистое, лохматое, возможно, от «мих» — мех. Такое прозвище давали человеку с густыми волосами или бровями, либо тому, кто носил меховую одежду. Менее вероятна, но возможна связь с тюркским корнем «миш» — соболь или куница, что тоже указывало бы на пушнину или охотника.

Суффикс -ов в основе фамилии — типичный патронимический формант, указывающий на принадлежность: «сын Мишуста». Модель образования простая и распространённая в центральной России и Поволжье. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская. В документах она встречается с XVIII века, в основном в южнорусских и волжских губерниях — например, в Тамбовской, Саратовской, Астраханской.

Примечательная деталь: фамилия Мишустов, а следовательно и Мишустова, почти не имеет однокоренных «двойников» в русском ономастиконе. Нет вариантов Мишустин или Мишустев — это говорит о редкой основе. Сравните с фамилией Мишустин, где корень «мишуст» мог быть диалектным вариантом слова «мешок» или «мих» (мех), но Мишустов — самостоятельная ветвь. Различие в суффиксе (-ов vs -ин) часто указывает на разную региональную традицию: -ин типичен для северных и рязанских земель, -ов — для южных и восточных.

Таким образом, предок носительницы фамилии Мишустова — человек по прозвищу Мишуст, живший, вероятно, в южнорусской или волжской местности, занимавшийся охотой, скотоводством или просто выделявшийся внешностью. Фамилия сохранила редкое слово, которое сейчас почти не употребляется, но в прошлом было живым и понятным.