Фамилия Мисилин образована от прозвища Мисила. Оно, предположительно, берет начало от украинского глагола «мiсить», то есть «смешивать, перемешивать, разминать массу». Вероятно, именование Мисила относится к профессиональным и указывает на род занятий его обладателя. Так могли назвать пекаря, гончара или строителя. Можно также предположить, что прозвища Мисила восходит к нарицательному «миса» со значением «большая тарелка». В таком случае, именование Мисила могло принадлежать тому, кто занимался изготовлением или продажей посуды. Так и прозвище Мисила закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Мисилин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мисила, со временем получил фамилию Мисилин.