Фамилия Миссирова — женская форма от Миссиров, и её разбор стоит начать с неочевидного: с суффикса. В русских фамилиях суффикс -ов встречается сплошь и рядом, но здесь он присоединён к основе, которая не похожа на стандартное славянское имя или прозвище. Это указывает на то, что корень, скорее всего, иноязычный.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В татарском, башкирском, казахском и других тюркских языках есть слово «миссир» или близкие к нему формы, означающие «Египет». Точнее, «Миср» — это арабское и тюркское название Египта. Соответственно, Миссиров — это «египтянин» или «тот, кто родом из Египта». В русских документах XVI–XVII веков так могли называть выходцев из Османской империи или Средней Азии, которые побывали в Египте или имели с ним торговые связи. Фамилия закрепилась за татарскими, башкирскими родами, а позже, через смешанные браки, вошла и в русскую среду.

Менее вероятная, но существующая гипотеза — связь с арабским именем Мисри (также «египетский»), которое давали ребёнку в честь паломничества или путешествия. В таком случае фамилия Миссиров — это русифицированная форма отчества от этого имени: «чей? — Миссиров сын». Суффикс -ов здесь играет ту же роль, что и в фамилиях Иванов или Петров, только основа не славянская, а восточная.

Географически фамилия Миссирова (и Миссиров) встречается в Поволжье — в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Самарской областях. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: именно через эти регионы шла торговля с Востоком и оседали купцы и ремесленники из арабских стран.

Сословно предки носителей фамилии могли быть как служилыми людьми (переводчиками, толмачами), так и торговцами. Египет в те времена был не столько географической точкой, сколько символом далёкой и богатой земли — прозвище «Миссир» могло закрепиться за человеком, который привёз оттуда редкий товар или знал арабский язык. Фамилия редкая, не попавшая в массовые списки дворянства, что говорит о её происхождении из среды посадских людей или крестьян, получивших фамилию при переписях уже в XIX веке.