Фамилия Миссиров — редкая, и её происхождение неочевидно. Скорее всего, она образована от прозвища или профессии, связанной с арабским или тюркским словом «миссир» (иногда «мисри»), что означает «египетский» или «относящийся к Египту». В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, «Мисри» — это Египет, а «мисри» — человек родом оттуда или купец, торгующий с Египтом. Соответственно, Миссиров — «сын Миссира», то есть потомок человека, которого прозвали египтянином.

Модель образования типична для русских фамилий тюркского происхождения: основа (Миссир) плюс патронимический суффикс -ов. Фамилия могла возникнуть в среде татарской или башкирской знати, а также среди торговых людей, имевших связи с Востоком. Встречается она преимущественно в Поволжье и на Урале, что подтверждает её восточные корни.

Есть и другая, менее вероятная версия: от имени Миссир — варианта имени Мисир, которое восходит к арабскому «Миср» (Египет). В этом случае фамилия просто фиксирует личное имя предка. Однако прозвищная версия (по месту происхождения или занятию) выглядит убедительнее, так как в ономастике чаще встречаются фамилии, указывающие на иноземное происхождение носителя, нежели на чисто именную основу.

Сравните с однокоренными фамилиями: Мисриев, Мисриков, Мисербиев. Все они редки и указывают на связь с тюркским или арабским миром. Фамилия Миссиров не имеет отношения к русскому слову «миссия» или к европейским именам — это чисто восточный след в русской фамильной системе.