Фамилия Мисурагин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа не лежит на поверхности, и в отличие от большинства русских фамилий, здесь не работает простой разбор по схеме «имя или профессия + суффикс». Чтобы понять корень, нужно отбросить типичный фамильный суффикс -ин и присмотреться к остатку — «Мисураг».

Первая и наиболее вероятная версия связывает фамилию с тюркскими языками. В них есть корень, близкий к «мисюр» или «мисри», что восходит к арабскому «Миср» — название Египта. В тюркской среде «мисри» могло означать «египетский», а также «египетская сталь» или «булат» (откуда пошло слово «мисюрка» — вид шлема из такой стали). Прозвище Мисураг или Мисурак могли дать мастеру, работавшему с булатом, торговцу оружием, либо человеку, который побывал в Египте или имел с ним торговые связи. Суффикс -аг/-ак в тюркских заимствованиях часто превращался в -а́г, а затем адаптировался русским окончанием -ин. Таким образом, Мисурагин — потомок человека по прозвищу Мисураг, то есть «булатный» или «египетский».

Вторая версия, менее убедительная, предполагает искажение более известной фамилии Мисюрев или Мисюрин. Эти фамилии происходят от канонического имени Михаил в его народных формах (Мисюр, Мисюра). Но переход «Мисюр» → «Мисураг» фонетически сложен и требует дополнительных допущений, поэтому тюркское происхождение выглядит правдоподобнее.

Географически фамилия встречается крайне редко. Основные следы ведут в Поволжье и Приуралье — регионы, где веками соседствовали русские и тюркские народы, и где подобные заимствования в фамилиях не редкость. Сословно носители фамилии, скорее всего, были из крестьян или мещан, так как дворянские роды с таким корнем не фиксируются.

Однокоренных фамилий в русском языке практически нет. Можно назвать разве что Мисуркин (от того же «мисюр»), но и она редка. Это делает Мисурагина уникальным случаем: фамилия не просто указывает на профессию или внешность предка, а сохраняет память о средневековых торговых и культурных связях с Востоком, где «египетская сталь» была символом качества и мастерства.