Фамилия Мисурина — женская форма фамилии Мисурин, а корень у обеих один. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с основой «Мисур-». В русских фамилиях на -ин суффикс обычно указывает на принадлежность: «чей сын?» — «Мисурин». Основа же могла возникнуть из прозвища или из имени.

Самый вероятный путь — от прозвища Мисура. В русских говорах, особенно на юге и в центральных областях, «мисура» или «мисюрка» — это старинный воинский головной убор, разновидность шлема с бармицей. Слово пришло из арабского или турецкого через посредничество польского языка (misurka). Прозвище Мисура могли дать человеку, который либо носил такой шлем (например, служилый человек, стрелец), либо имел с ним внешнее сходство — например, круглую голову или своеобразную причёску. В этом случае фамилия Мисурин — «сын того, кого звали Мисура» — относится к так называемым «ремесленным» или «предметным» прозвищам по вещи.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с каноническим именем Мисур или Мисурка, которое могло быть уменьшительной формой от крестильных имён вроде Мисаил или Дмитрий (через народное «Митя» → «Мисюра»). Такие сокращения типичны для русской бытовой ономастики XVI–XVII веков. Однако у этой гипотезы меньше поддержки: имя Мисур не фиксируется в святцах, а прозвищная версия с конкретным значением (шлем) выглядит убедительнее.

Географически фамилия Мисурин встречается не повсеместно, но имеет заметные очаги в Поволжье и на Урале, а также в некоторых районах Центральной России. В переписных книгах XVII века можно найти упоминания служилых людей по фамилии Мисурины, что косвенно подтверждает «военную» версию происхождения от головного убора. Среди однокоренных фамилий — Мисюрин, Мисюрев, Мисуркин; все они, скорее всего, восходят к тому же корню, но с разными суффиксами.

Таким образом, фамилия Мисурина, скорее всего, ведёт род от человека, имевшего прозвище по предмету военного снаряжения — мисурке. Предки носителей этой фамилии могли быть служилыми людьми, казаками или стрельцами, носившими такой шлем, либо получили прозвище за внешнюю схожесть с ним.