Фамилия Мисурагина звучит непривычно для русского уха — и это первый ключ к её происхождению. В русской ономастике нет ни основы «мисур», ни суффикса «-агин», который был бы продуктивным в фамилиях. Скорее всего, перед нами не исконно русская, а адаптированная на письме фамилия, которая в исходном виде выглядит иначе.

Самый вероятный вариант: Мисурагина — это русифицированная форма грузинской фамилии Мисурадзе или Мисуридзе. В грузинском языке фамилии на «-дзе» (сын) и «-швили» (дитя) при записи в российских документах XIX–XX веков часто утрачивали окончание, а вместо него получали русский суффикс «-ин», указывающий на принадлежность. Основа «Мисура» или «Мисури» могла восходить к грузинскому слову «мис» (мед) или к имени собственному Мисур, но точное значение теряется в диалектах. Женская форма Мисурагина (с суффиксом «-агин»?) — это, вероятно, искажение при переписи: правильнее было бы Мисурадзева или Мисуридзева, но писарь записал на слух, добавив «-гин» вместо «-дзе».

Вторая версия, менее распространённая, но возможная: фамилия могла возникнуть от прозвища Мисурага. В некоторых говорах русского севера, особенно в Архангельской области, «мисура» — это старинное название шлема (от латинского missura через польское misiurka). Человек, носивший такой шлем или делавший их, мог получить прозвище Мисурага (с суффиксом «-ага», характерным для прозвищ, например, Борода — Бородага). Тогда Мисурагин — «сын Мисураги», а Мисурагина — женская форма по мужу. Однако такое прозвище крайне редкое, и в документах XVII–XVIII веков оно почти не встречается.

Третий, экзотический вариант: фамилия могла возникнуть у народов Поволжья (татар или чувашей), где основа «мисур» означает «египтянин» (от арабского Миср — Египет). В таком случае Мисурагин — это потомок человека, которого звали Мисур (Египтянин), а суффикс «-гин» — искажённое «-кин» или «-гин» от тюркского притяжательного аффикса. Но это лишь гипотеза, так как массовых миграций египтян в Россию не было, а единичные случаи дали бы другую форму (например, Мисуров).

География фамилии сегодня — в основном центральная Россия и Москва. Найти Мисурагиных в массовых переписях XIX века почти невозможно: фамилия редкая, и её носители, скорее всего, были выходцами из Закавказья (грузины, которые переехали в Россию в советское время). Если вы встретили эту фамилию в старых метрических книгах — это почти наверняка ошибка писаря, который записал грузинскую фамилию на слух. В любом случае, корень фамилии — не русский, а заимствованный, и её значение тесно связано с историей семьи, а не с общим словарём.