Фамилия Митрунин — яркий пример того, как редкая словообразовательная модель помогает сузить круг поиска предков. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев, суффикс -ин здесь указывает на принадлежность к конкретному лицу, но не к отцу, а, скорее всего, к матери или к более сложному прозвищу. Основа фамилии — Митрун. Это не каноническое имя, а производная форма.

Скорее всего, Митрун — это обиходный вариант крестильного имени Дмитрий. В русской народной традиции имя Дмитрий давало целый веер уменьшительных форм: Митя, Митюха, Митюша и, что важно, Митрун. Суффикс -ун в таких образованиях (ср. Петрун от Пётр, Гришун от Григорий) придавал имени оттенок ласкательности или принадлежности к определённой социальной среде — часто так называли в крестьянской или ремесленной среде. Таким образом, Митрун — это «маленький Дмитрий» или «Дмитрий, которого звали по-домашнему».

Фамилия Митрунин образована по притяжательной модели: «чей?» — Митрунин, то есть сын, потомок или человек из семьи Митруна. Это типично для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на юге. В отличие от фамилий на -ов, которые часто образовывались от прозвищ на -о (Митро, Митруша), -ин чётко привязывает носителя к конкретному имени-прозвищу.

Интересно, что фамилия Митрунин могла возникнуть и в среде, где имя Дмитрий было особенно популярно. Например, в старообрядческих общинах или в регионах с сильным почитанием святого Дмитрия Солунского. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: возможно, родоначальник был известен в одной деревне или волости под этим прозвищем, и фамилия закрепилась за его потомками, не распространившись широко.

Версия о том, что основа Митрун могла быть самостоятельным прозвищем (не от Дмитрия), менее правдоподобна. В русской ономастике нет устойчивого апеллятива «митрун» (в отличие, скажем, от «митрофан»). Поэтому связь с каноническим именем остаётся основной. Если ваш предок носил фамилию Митрунин, с высокой вероятностью его звали Дмитрий, а сама фамилия указывает на происхождение из крестьянской или мещанской среды центральной или северной России, где такие формы имён были в ходу.