Фамилия Мизеркин образована от прозвища Мизерка, и в её основе лежит заимствованное слово, что сразу определяет верхнюю границу её возраста. Слово «мизер» пришло в русский язык из французского и означало «бедный, скудный», а также «слабый, хилый» или «маленький». Поэтому Мизеркой в старину могли прозвать человека небогатого, болезненного или того, кто выделялся невысоким ростом и миниатюрным сложением.

Поскольку основная волна французских заимствований пришлась на XVIII век, логично предположить, что прозвище Мизерка не могло появиться раньше этого времени. Это довольно поздний пласт русских прозвищ, что делает фамилию Мизеркин относительно молодой по сравнению с фамилиями, образованными от древних славянских имён или прозвищ.

Сама модель образования проста и прозрачна: к основе Мизерк- добавился типичный русский фамильный суффикс -ин, указывающий на принадлежность: Мизеркин — это «сын Мизерки», потомок человека с таким прозвищем. Такая словообразовательная схема характерна для фамилий, возникших в среде простого сословия, где прозвище закреплялось за главой семьи и переходило к детям.

Интересно, что слово «мизер» в русском языке сохранило двойственный оттенок: с одной стороны, это что-то крайне малое, незначительное, с другой — в карточной терминологии «мизер» означал игру, где игрок обязуется не взять ни одной взятки. Вряд ли прозвище Мизерка имело отношение к картам, но сама многозначность корня могла порождать разные трактовки.

Несмотря на кажущуюся прозрачность, происхождение фамилии не всегда однозначно. В некоторых говорах могло существовать и диалектное слово, созвучное «мизеру», но имеющее иное значение. Однако версия о французском заимствовании остаётся основной и наиболее убедительной.

Безусловно, фамилия Мизеркин представляет собой замечательный памятник славянской культуры, но процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности. Поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Мизеркин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.