Фамилия Мизеркин — редкий пример того, как в русской антропонимии прижилось слово, пришедшее из французского языка. В основе фамилии лежит прозвище Мизерка, которое, в свою очередь, образовано от заимствованного слова «мизер». Во французском языке оно означает «бедный, скудный», а также «слабый, хилый» или «маленький». Поэтому Мизеркой в народе могли прозвать человека небогатого, болезненного или же того, кто выделялся миниатюрным сложением и невысоким ростом.

Прозвище закреплялось за человеком как его основное бытовое именование, а затем, по распространенной русской модели, легло в основу фамилии. Суффикс -кин указывает на принадлежность: Мизеркин буквально означает «сын Мизерки», то есть потомок человека с таким прозвищем. Такой способ образования фамилий от прозвищ с уменьшительным суффиксом -ка был очень типичен для северных и центральных русских говоров, где подобные формы использовали особенно охотно.

Любопытно, что слово «мизер» в русский язык попало не напрямую из бытового общения, а скорее через карточную терминологию или речь образованных слоев, где оно сохраняло значение чего-то малого и незначительного. Однако в народной среде прозвище Мизерка могло возникнуть и независимо, просто как меткая характеристика внешности или достатка. В этом смысле фамилия отражает не столько социальный статус предка, сколько ту черту, которая бросалась в глаза окружающим.

Стоит отметить, что у фамилии нет связи с еврейскими или немецкими корнями, несмотря на внешнее сходство с иными фамилиями. Это чисто русское образование от нарицательного слова, и в этом его ценность для исследователя: оно показывает, как легко и естественно язык осваивал чужие слова, превращая их в личные имена. Сегодня Мизеркины встречаются редко, но сама фамилия сохранила память о том, как когда-то одного из предков за глаза называли Мизеркой — за худобу, бедность или небольшой рост.