Фамилия Мижуева — женская форма от Мижуев, и её разбор стоит начать с суффикса. Перед нами не самая частая, но показательная модель: -ев при основе на мягкий согласный или -й. В данном случае основа «Мижуй» дала суффикс -ев, а не -ов, что уже указывает на древность или севернорусское происхождение фамилии (в говорах, где «у» звучало твёрже, могло быть и Мижов, но закрепился вариант Мижуев).

Корень «Миж-» — тёмный. Самый прямой путь — от прозвища Мижуй. В русских говорах «мижуй» или «мижую» могло означать человека, который «мижит», то есть щурится, жмурится, смотрит прищурясь. В словаре Даля «мижить» — щурить глаза, а «мижурка» — подслеповатый человек. Прозвище давали тому, кто косил глазами или щурился от яркого света. Вторая версия — от диалектного «миж» (межа, граница), но тогда фамилия выглядела бы как Межев или Межуев. Это маловероятно: звук «и» вместо «е» в корне — устойчивый признак другого слова.

Есть и более редкая гипотеза: Мижуй — вариант имени Миша (Михаил) в местном произношении. В некоторых говорах «шу» и «жу» смешивались, и Мишуй превращался в Мижуй. Однако это допущение слабое: переход «ш» в «ж» в имени нехарактерен, и нет устойчивой традиции такой замены.

Географически фамилия Мижуевых встречается в Поволжье и на Урале, особенно в Пермской и Вятской губерниях. Это объяснимо: в тех краях «мижить» было живым словом, а фамилии на -ев активно формировались из прозвищ в XVI–XVII веках. Выходит, предок Мижуевых — скорее всего, крестьянин или посадский человек, которого окрестили за особенность зрения, и прозвище закрепилось за родом.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Мижов, Мижурин, Мижин — показывает, что Мижуев стоит особняком: у него суффикс, типичный для притяжательных фамилий от личного прозвища, а не от названия профессии или места. Это делает фамилию характерным примером «глазного» прозвища, каких в русской ономастике немало (Кривошеев, Щуров, Жмуркин).