Фамилия Мизяева образована от мирского имени Мизяй, которое в древности выполняло роль неофициального личного прозвища. В южнорусских говорах словом «мизя» называли неженку и избалованного человека, поэтому имя могло закрепиться за долгожданным и горячо любимым сыном, которого родители баловали. Возможна и другая связь — с украинским глаголом «мизати», то есть «ласкаться», что усиливает ту же смысловую окраску: Мизяй — ласковый, изнеженный ребёнок.

Существует и третья, не менее правдоподобная версия, которая выводит имя из украинских слов «мизинный» (младший, маленький) и «мизинец» (младший ребёнок). В этом случае Мизяем называли самого маленького в семье, подчёркивая его миниатюрность и возраст. Обе трактовки не противоречат друг другу: в основе лежит нежный, уменьшительный образ, что типично для мирских имён той эпохи.

Подобные прозвища — Малик, Малюк, Малец, Малой — были широко распространены у восточных славян в XI–XVI веках, причём среди всех сословий и на всей территории их расселения. Они не несли негативного оттенка, а, наоборот, выражали родительскую теплоту. Потомки человека по имени Мизяй со временем закрепили за собой фамилию Мизяева, которая в мужском роде звучит как Мизяев. Суффикс -ев указывает на принадлежность: буквально это «сын Мизяя», что делает фамилию типичным примером русской патронимической модели.