Основой фамилии Мизякин послужило мирское имя Мизяка. Фамилия Мизякин образована от прозвища Мизяка. В его основе лежит украинское слово «мизя», которое переводится на русский как «плакса». Вероятно, подобное прозвище мог получить капризный человек. В то же время Мизякой могли называть младшего ребенка в семье. К таким прозвищам относится и Мизяка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мизяка, со временем получил фамилию Мизякин.