Фамилия Моченко — украинская по происхождению, что выдают суффикс -енко и словообразовательная модель. В украинской ономастике суффикс -енко традиционно означал «сын» или «потомок» и закрепился в фамилиях на востоке и в центре Украины. Таким образом, Моченко — это «сын Мочки» или «потомок человека по прозвищу Мочка».

Прозвище Мочка могло возникнуть от глагола «мочить» или существительного «мочка» — в старину так называли не только ушную мочку, но и небольшой моток ниток, пряди льна, а также влажное место, низину. Вероятнее всего, прозвище относилось к человеку, который жил у воды, на сырой почве, или же к тому, кто занимался вымачиванием льна и конопли — важным этапом в производстве пряжи. В южнорусских и украинских говорах «мочка» также означала «кисть», «пучок», что могло указывать на внешность или род занятий.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с личным именем Мокей (греческое «насмешник»). В народной речи имя Мокей могло сокращаться до Мочка, и от этой уменьшительной формы образовалась фамилия.

Фамилия Моченко распространена преимущественно на территории Украины, особенно в центральных и восточных областях, а также среди украинской диаспоры. В России встречается реже, чаще всего в регионах, граничащих с Украиной, или в местах переселения. В исторических документах фамилия фиксируется с XVIII века, но массово — уже в XIX веке, в метрических книгах Полтавской, Черниговской и Харьковской губерний.

По социальному составу носители фамилии Моченко в основном принадлежали к крестьянскому сословию, реже — к казацкой старшине или мещанам. Среди известных носителей можно назвать украинского футболиста и тренера, но в целом фамилия не является широко разрекламированной. Её ценность — в чёткой и прозрачной этимологии, которая сразу даёт понять, кем мог быть предок: человеком, жившим у воды, или ремесленником, работавшим со льном.