Фамилия Могильницкий в первой версии восходит к названию села Могильницы в Тернопольской области или к городу Могилев, который стоит и в Белоруссии, и на Украине. При первом разделе Речи Посполитой в 1772 году Могилев отошел к Российской империи и стал центром Могилевской губернии. Топонимическая модель тут прозрачна: суффикс -цкий указывал на связь человека с местом, откуда он родом или где владел землей. Такие фамилии в старину носили в основном знатные люди, и это сразу выделяет Могильницких из массы крестьянских родов на -ов и -ин.

Но есть и другая версия, которая уводит от географии к ботанике. Словом «могильница» в народе называли барвинок малый, он же плющ, — многолетнее вечнозеленое растение семейства кутровых. Возможно, основатель рода жил в доме, который стоял в зарослях плюща, и соседи дали ему прозвище Могильницкий. Эта гипотеза менее надежна, чем топонимическая, но она объясняет, почему фамилия могла возникнуть независимо в разных местах.

Третья версия связывает род с Молдавией. Первое историческое сведение о фамилии Могила относится к 1499 году, когда среди трех претендентов на валахский престол упоминался Моисей Могила. К середине XVI века Иоанн Могила занимал высшую в Молдавии должность — логофета. Его сын Иеремия стал господарем молдавским (1595–1606), второй сын Георгий — митрополитом молдавским, третий, Симеон, — воеводой волошским и отцом знаменитого митрополита Петра Могилы. Дочь Иеремии Раина, бабка польского короля Михаила, ревностно защищала православие и учреждала монастыри. Родственная связь с поляками дает основание полагать, что позже представители рода Могила переехали в Польшу, и к фамилии добавился характерный суффикс -цкий.

Если принять эту версию, цепочка преобразования выглядит так: от прозвища Могила образовали прилагательное Могильницкий, а потомок человека с таким прозвищем со временем получил фамилию Могильницкий. Формант -цкий в сочетании с вставным -н- типичен для польской и украинской традиции, где так оформляли фамилии от названий мест или родовых прозвищ. Слабое место этой гипотезы в том, что между молдавскими Могилами и конкретными Могильницкими нет документированной связи, поэтому она остается скорее семейным преданием, чем доказанным фактом.

Среди известных однофамильцев выделяется Антоний Любич Могильницкий (1811–1873), галицко-русский поэт, писатель, общественный и политический деятель, униатский священник. Он написал повесть «Конгруа отца Жегаловича», «Повесть старого Савы с Подгорья», сатирическую поэму «Песнь поэта» и несколько «Дум». Его пример показывает, что фамилия бытовала в галицкой среде, где польское и украинское влияние переплеталось, — а это косвенно поддерживает и географическую, и молдавскую версии происхождения.